Como director de escena o escenógrafo de ópera ha puesto en escena 60 títulos, de los siglos XVII al XX, con autores como Monteverdi, Purcell, Johann Sebastian Bach, Händel, Salieri, Mozart, Beethoven, Rossini, Bellini, Donizetti, Verdi, Wagner, Johann Strauss h., Bizet, Offenbach, Massenet, Mascagni, Leoncavallo, Puccini, Mussorgsky, Rimsky-Korsakov, Richard Strauss, Wolf-Ferrari, Zemlinsky, Stravinsky, Poulenc o Perusso.

Mario Pontiggia ha firmado más de 150 producciones en Argentina (Buenos Aires, La Plata) ; Italia (Catania, Cagliari, Ferrara, Firenze, Napoli, Palermo, Reggio Emilia, Sassari, Taormina, Torino, Bari) ; Portugal (Vila Real, Lisboa) ; España (Bilbao, Córdoba, La Coruña, Las Palmas de Gran Canaria, Oviedo, Palma de Mallorca, Pamplona, Santiago de Compostela, Santa Cruz de Tenerife) ; Francia (Sanxay, Toulouse) ; Mónaco (Monte-Carlo) ; Suiza (Zúrich – Winterthur) ; Croacia (Zagreb) o Japón (Hamamatsu, Nagoya, Osaka, Ôtsu, Shibuya, Tokyo, Yokohama). Ha tenido el honor de inaugurar el Grimaldi Forum de Mónaco (2000) y el nuevo Teatro del Maggio Musicale Fiorentino de Florencia (2014). En Buenos Aires, su producción de Boris Godunov (Teatro Colón / 2006) fue nominada al premio ACE de la crítica argentina; para el mismo teatro firmó también Elektra (premio ACE 2007).